足协杯第二阶段抽签仪式在苏州进行，其中李铁和黎兵作为抽签嘉宾出席。

其中第二轮一共8场比赛，分为16个签位，中超的8支球队落位主队签位，分列1-8号，而来自中甲的8支球队落位客队签位，分列9-16号。与此同时，对阵关系是按1对9、2对10、3对11、4对12、5对13、6对14、7对15、8对16的方式依次确定。

已经通过第一轮的中超8支球队分别是广州恒大、江苏苏宁、山东鲁能、北京国安、上海上港、武汉卓尔、天津泰达、广州富力。其中8支中甲的球队包括了长春亚泰、成都兴城、梅州客家、浙江绿城、昆山FC、泰州远大、2个保级组头名。

最终经过抽签，广州恒大和上海上港领衔上半区，山东鲁能和北京国安领衔下半区。其中广州恒大和江苏苏宁无疑抽到上上签，因为对手实力一般般，还有山东鲁能和北京国安，其中山东鲁能和北京国安这对冤家有希望在半决赛相遇。

具体对决如下：

上半区：

广州恒大VS昆山FC

江苏苏宁VS梅州客家

天津泰达VS梅州赛区第一

上海上港VS长春亚泰

下半区：

北京国安VS成都兴城

武汉卓尔VS泰州远大

广州富力VS常州赛区第一

山东鲁能VS浙江绿城

根据赛场，足协杯第二轮的比赛日期为11月26日，地点为苏州赛区，延续单场定胜负